La molécula aparece n grados girada alrededor de uno de los ejes X Y Z
 
script="rotate {x|y|z}(n)"
Una molécula aparece girada n grados alrededor de uno o varios  ejes
EJEMPLO:
La imagen de la derecha aparece girada 90 grados alrededor del eje Y con respecto a la de la izquierda
 
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<embed src="ala.pdb" height=200 width=200 display3D=ball&stick script="rotate y 90">